Рейтинговое исследование проводится испанской исследовательской группой Cybermetrics Lab. Как сообщает сайт Проекта "5-100", Рейтинг Webometrics выходит дважды в год, в конце января и в конце июля. Методология исследования основывается на четырех индикаторах с разным весом: количество ссылок с других ресурсов, размер сайта (количество веб-страниц, проиндексированных Google), академическое качество (цитируемость научных публикаций на основе аналитических данных исследовательской группы SCImago) и открытость (количество загруженных на сайт и проиндексированных поисковой системой Google полнотекстовых файлов).
Из числа вузов-участников Программы повышения конкурентоспособности в обновленные показатели рейтинга вошли 20 вузов, включая участников Проекта "5-100" "второй волны", таких как СФУ, РУДН, ЮУрГУ, ТюмГУ, Первый МГМУ, БФУ им. И.Канта.